这部电影讲述的是蝙蝠侠（由罗杰·克雷格·史密斯配音）、罗宾和正义联盟成员、闪电侠和绿箭侠对抗一个名为Animilitia的犯罪组织的故事。这个犯罪组织由一些动物成员组成，包括银背大猩猩、猎豹女孩、杀人鳄鱼等。他们在哥谭市做了很多坏事，普通警察对他们束手无策。此外，该组织背后的主谋指向蝙蝠侠的死敌，他也是哥谭市无所不能的黑手党大亨企鹅角色的声音。除了Animilitia之外，蝙蝠侠等人还要面对奥斯瓦尔德的商人新发明的邪恶网络动物机器人，一群罪恶的邪恶势力再次聚集在哥谭市。