故事以“猿流感”病毒在全球蔓延为背景，人类几近毁灭，进化成高级智慧生物的猿类成为食物链顶端的王者。时过境迁，暴虐的猿人首领凯撒(凯文·杜兰·凯文·杜兰饰)在废墟上建立了猿人历史上的第一个帝国——“猿人星球”的崛起，这是一个新的世界秩序诞生的曙光。神秘的人类女孩诺瓦(芙蕾雅·艾伦·芙蕾雅·艾伦饰)的出现引起了塞萨尔的警惕。她似乎掌握着一个巨大的秘密，这个秘密不仅关系到人类的生存，甚至可能再次颠覆整个《人猿星球》。被迫逃亡的诺娃在逃离凯撒军队的过程中，遭遇了幼猿诺亚(欧文·提格饰)的命运，开启了冒险之旅。