故事讲述了20世纪20年代初，天灾人祸不断，百姓苦不堪言。一些别有用心的人趁机闹事。体内藏着龙魂的年轻医生杨毅，因为鼠疫事件被卷入上海各种势力的复杂斗争中，于是认识了上海市长莫森的女儿莫小玉，并爱上了她。幕后黑手，更是杨仪叔叔的身份，因其疯狂追求“长生不老”妄想，不惜人为传播瘟疫，用人工药材炼制禁药赚取暴利，甚至不惜重金刺杀政客，挑起军阀冲突诱发战争，但他的最终目的却是为了达到制造“六害”，牺牲众生鲜血换取个人长生不老的邪恶目的。